上海市精神卫生中心作为上海交通大学医学院附属医院及精神医学学系所在地，构建了覆盖本科生至博士后的完整学历教育体系，是国内精神医学与心理学高层次人才培养的核心基地。

上海交通大学医学院精神医学学系设有三个教研室：精神病学教研室、上海渥太华精神医学教研室和心理学教研室，承担上海交通大学医学院临床医学、儿科学、预防医学相关专业中《精神病学》的理论教学、临床见习与实习带教工作。同时还承担交通大学医学院本科生的《医学心理学》、《普通心理学》、《大学生心理健康教育》等课程。同时也作为复旦大学、同济大学等多所知名高校的教学医院，共同参与精神医学相关课程的临床教学与实践指导。

研究生教育是中心学历教育的重点，拥有国内精神专科医院中最完备的学位授权体系。中心是国内唯一同时具备精神病与精神卫生学、心理学两个一级学科博士点、硕士点及博士后流动站的精神专科医院。在精神病与精神卫生学专业方面，中心现有博士研究生导师23名、硕士研究生导师8名，每年招收学术学位和专业学位硕士研究生，2024年计划统考招收学术学位硕士8人、专业学位硕士5人。在心理学专业方面，中心于2011年获心理学一级学科硕士点，2014年获应用心理硕士专业学位点，2015年增设“神经科学与心理学”交叉学科博士点，2020年正式获批心理学一级学科博士点，现有博士生导师15名、硕士生导师17名。心理学专业博士研究生培养涵盖临床心理学、社会心理与心理健康、认知神经科学三个方向。

在培养模式上，中心依托国家精神疾病医学中心、上海市重性精神病重点实验室等高能级平台，形成了“临床+科研”并重的培养特色。研究生在学期间可参与国家级重大科研项目，并享有赴哈佛大学、剑桥大学等世界顶尖院校的短期访学资助机会。临床医学专业学位硕士研究生同时接受住院医师规范化培训，须符合国家执业医师资格考试报考条件。

此外，中心设有博士后科研流动站，持续招收精神病与精神卫生学、心理学方向的博士后研究人员，形成了从本科教学、硕博士培养到博士后深造的全链条医学教育体系。